Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALD1Q05682 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms