Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP1Q04837 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms