Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TOP2BQ02880 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms