Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASIC1P78348 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms