Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EEF1A1P68104 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EEF1A1P68104 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms