Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms