Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SMARCA4P51532 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SMARCA4P51532 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms