Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms