Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP153P49790 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP153P49790 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP153P49790 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP153P49790 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP153P49790 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP153P49790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP153P49790 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms