Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQGAP1P46940 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQGAP1P46940 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms