Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UTRNP46939 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UTRNP46939 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UTRNP46939 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms