Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC27P30260 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC27P30260 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms