Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA3P26006 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms