Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNFSF4P23510 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF4P23510 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms