Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CD247P20963 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD247P20963 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD247P20963 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD247P20963 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD247P20963 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD247P20963 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms