Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HLA-DOBP13765 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms