Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MS4A1P11836 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A1P11836 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms