Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM228BP0C875 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms