Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DOAP06340 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DOAP06340 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms