Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYBBP04839 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYBBP04839 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms