Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D2O95562 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms