Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDE8BO95263 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE8BO95263 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms