Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC45O75419 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC45O75419 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC45O75419 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC45O75419 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC45O75419 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC45O75419 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms