Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYTH3O43739 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYTH3O43739 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms