Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF208O43345 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF208O43345 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms