Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP3O43295 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP3O43295 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms