Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SIAH2O43255 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms