Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIBO00712 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIBO00712 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFIBO00712 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFIBO00712 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms