Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TULP2O00295 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TULP2O00295 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TULP2O00295 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TULP2O00295 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms