Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP1O00294 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP1O00294 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP1O00294 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TULP1O00294 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TULP1O00294 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms