Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN8O00124 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms