Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOBPA7XYQ1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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