Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 NPM1P30-201ENST00000425092 828 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PACSIN3Q9UKS6 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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