Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RTL8BQ17RB0 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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