Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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CDH18Q13634 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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