Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 FCRL5-201ENST00000361835 5390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
COL4A5P29400 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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