Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
USP18Q9UMW8 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
USP18Q9UMW8 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms