Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
ACADSBP45954 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
ACADSBP45954 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms