Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AKR1D1-202ENST00000411726 2234 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPAP3-201ENST00000005386 4370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF887P-201ENST00000431363 1407 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AGK-203ENST00000473247 1550 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 GC-204ENST00000504199 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 VWA5A-202ENST00000392744 2691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MTND6P16-201ENST00000504006 520 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 HHAT-201ENST00000261458 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 LIMCH1-209ENST00000509277 3474 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ASAP3-209ENST00000495646 2552 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 HSD11B1-202ENST00000367027 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 MARCH1-214ENST00000514618 3903 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC027045.2-201ENST00000634974 1571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC01924-201ENST00000589376 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 ANO4-207ENST00000550015 2293 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC007614.2-201ENST00000569877 1851 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TRHP20396 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 NUP210L-202ENST00000368553 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 CERS3-201ENST00000284382 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 EYA4-201ENST00000355167 5692 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms