Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 UCMA-201ENST00000378681 826 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC011294.1-201ENST00000487094 844 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC009927.2-201ENST00000520812 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 KIAA1328-209ENST00000592521 1190 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RAB5AP20339 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB5AP20339 LINC02556-201ENST00000450776 346 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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