Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OR6M2P-202ENST00000641780 2063 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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VPS8Q8N3P4 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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VPS8Q8N3P4 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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