Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC104211.2-201ENST00000521317 436 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC011487.2-201ENST00000600193 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC110760.2-202ENST00000507517 946 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LSM5-202ENST00000409292 538 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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