Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 OR52A1-201ENST00000328942 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ACTN2P35609 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms