Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PTPRMP28827 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PTPRMP28827 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PTPRMP28827 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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