Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF385D-AS2-202ENST00000448980 370 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ENTPD1-AS1-206ENST00000449197 523 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC005154.1-225ENST00000581665 564 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC006547.1-208ENST00000598339 805 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC012370.2-202ENST00000600508 1099 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CABYR-206ENST00000463087 1792 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
VPREB1P12018 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms