Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
SGCZQ96LD1 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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