Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SNAI1P1-201ENST00000428587 777 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 GAPDHP28-201ENST00000455134 1003 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF174-205ENST00000575752 1068 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SLC25A51-201ENST00000242275 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 C12orf54-201ENST00000314014 887 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RN7SKP75-201ENST00000363070 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 TMEM244-201ENST00000368143 545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CELSR3-AS1-201ENST00000421275 196 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CCNT2-AS1-203ENST00000428857 677 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ASH2LP1-201ENST00000438037 985 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC096543.2-201ENST00000449140 859 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RN7SL302P-201ENST00000475999 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RN7SL28P-201ENST00000488836 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 H2AFZP4-201ENST00000534148 377 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNPY1Q3B7I2 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms