Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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