Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CDH18Q13634 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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