Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
AP3M2P53677 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
AP3M2P53677 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms